В архиве, который вы скачали, есть папка gamedata.
Разархивируйте ее в корневой каталог игры. (пример C:/Games/S.T.AL.K.E.R/gamedata). Если в архиве нет папки gamedata, то создайте её в корневом каталоге игры и разархивируйте в неё содержимое архива. При этом разархивировывать архивы самой игры (.db) НЕ НУЖНО!

Если моды не конфликтуют друг с другом, то можно.
Посмотрите на набор файлов одного мода и на набор файлов другого мода.
Если у них есть одинаковые по названиям файлы имеющие одинаковое расширение и одинаковый путь (например: gamedata/scripts) - то они перекроют/заменят друг друга при установке, следовательно они несовместимы.

Удалите установленные моды (переместите папку gamedata из корневого каталога игры в другое место), поставьте интересующий вас мод и запустите игру, загрузите сохранение или начните новую игру, если игра не вылетела значит мод работает.
Правда есть вероятность, что изменения вносимые модом были включены в патч, следовательно мод не имеет смысла. Стоит ознакомиться со списком изменений вносимых патчем.

Раз на раз не приходится, вам необходимо это проверить самому (если автор мода не написал об этом) установив мод и загрузив сохранение.

Удалите мод удалив папку gamedata из корневого каталога игры. Если вам очень нужен этот мод обратитесь к разработчику мода и внимательно прочитайте инструкцию к моду.

Нет не нужна, программа нужна создателям модов.

Распакуй gamedata.db6 там папка texturesintro в ней все видеоролики по сюжету. Это файлики с расширением .omg. Нужны кодеки специальные, или этим плеером открываем , они без звука, но звуковые файлы находятся где-то там же, но с расщирением .ogg и с таким же названием как видеоролик.
Ещё есть видеоролики в папке sleep, это похоже его сны, которые вырезали....

Авторы мода утверждают, что он "должен быть совместим со всеми версиями"